1.菌丝  包括有隔菌丝 无隔菌丝 又可分为营养菌丝，气生菌丝，生长菌丝

营养菌丝
　　基内菌丝匍匐生长于营养基质表面或伸向基质内部，它们象植物的根一样，具有吸收水分和养分的功能。 放线菌化学式 　　有些还能产生各种色素，把培养基染成各种美丽的颜色。放线菌中多数种类的基内菌丝无隔膜，不断裂，如链霉菌属和小单孢菌属等；但有一类放线菌，如诺卡氏菌型放线菌的基内菌丝生长一定时间后形成横隔膜，继而断裂成球状或杆状小体。
气生菌丝
　　气生菌丝是基内菌丝长出培养基外并伸向空间的菌丝。在显微镜下观察时，一般气生菌丝颜色较深，比基内菌丝粗；而基内菌丝色浅、发亮。有些放线菌气生菌丝发达，有些则稀疏，还有的种类无气生菌丝。
孢子丝
　生殖菌丝是当气生菌丝发育到一定程度，其上分化出的可形成孢子的菌丝。放线菌孢子丝的形态多样，有直形、波曲、钩状、螺旋状、一级轮生和二级轮生等多种，是放线菌定种的重要标志之一。孢子丝发育到一定阶段便分化为分生孢子。在光学显微镜下，孢子呈圆形、椭圆形、杆状、圆柱状、瓜子状、梭状和半月状等，孢子的颜色十分丰富。孢子表面的纹饰因种而异，在电子显微镜下清晰可见，有的光滑，有的褶皱状、疣状、刺状、毛发状或鳞片状，刺又有粗细、大小、长短和疏密之分。

孢子是微生物所产生的一种有繁殖或休眠作用的细胞，能直接发育成新个体。孢子一般微小，单细胞。由于它的性状不同，发生过程和结构的差异而有种种名称。微生物通过无性生殖产生的孢子叫“无性孢子”，如分生孢子、孢囊孢子、游动孢子等；通过有性生殖产生的孢子叫“有性孢子”，如接合孢子、卵孢子、子囊孢子、担孢子等；直接由营养细胞通过细胞壁加厚和积贮养料而能抵抗不良环境条件的孢子叫“厚垣孢子”、“休眠孢子”

真菌营养要求不高，需氧，生长繁殖最适pH接近中性，最佳温度为25—30℃，但某些深部真菌为37℃，与人体温度相同。由于真菌繁殖一代的时间较长，因而培养时间也较久，应防止培养基干燥，或尽可能用试管。临床上常用沙保弱培养基。长出的菌落分为：酵母型菌落、类酵母型菌落和丝状菌落三种。酵母型菌落呈奶油色，硬度与细菌的菌落相似；镜检可见圆形或卵圆形壁薄真菌细胞，以发芽方式繁殖，幼芽成熟则脱离母细胞，这种孢子称为芽生孢子。类酵母菌落表面与酵母菌落相似，也呈奶白色或黄色，但有深入培养基的假菌丝。所谓的假菌丝，即培养基内菌细胞发芽，但芽不从母细胞脱离，而延长发育，继续发芽，细胞相连接形成分枝呈网状。丝状菌落由菌丝（气中菌丝、营养菌丝）组成，外观上可呈棉絮样、毛样、粉状、颗粒状，又因真菌孢子具有各种颜色，所 以通常称为“霉菌 ”。有不少属的真菌，可根据不同生活环境、不同的培养温度，生成不相同的菌落，镜下所见也不相同，这类真菌称为双相性真菌。真菌的菌落在真菌鉴定上是很重要的。一般菌丝体每30—40min就能产生一个新的菌丝，一旦被污染，蔓延速度很快。而培养基因菌落产生的水溶性色素而变成相应颜色，这对于鉴定真菌的种属都有重要意义。

菌落由单个细菌（或其他微生物）细胞或一堆同种细胞在适宜固体培养基表面或内部生长繁殖到一定程度；形成肉眼可见有一定形态结构等特征的子细胞的群落。