几乎所有超小型PC都可用面板编程。用户可以通过控制面板上的按键，进行编程、编辑、读取数据或输入数据，无须专门的工具或电缆。其编程简单易学，功能块的编程方法使稍有点电工知识的人可以在短时间内学会。除了用面板编程外，有的超小型 PC还可以和计算机联网。
如西门子公司的 LOGO! Soft V2．O就是LoGo!和计算机联网后在计算机上运行的软件包。该软件包有以下功能：离线生成用户程序；在计算机上仿真用户程序；打印；将用户程序存到硬盘或其它存储媒体上；程序传送(用户程序从LOGO!到计算机或者用户程序从计算机到LOGO!)。
又如三菱电机公司的简单应用控制器提供了AL—PCS／WIN—C型 V13软件包，是强有力的直观且界面友好的编程工具，可与三菱超小型PC联网。
V15软件使用了一种特殊而又简单的编程方式，即功能块方式。功能块是软件中预先编制的小结构块，可以在定义输入条件后，根据用户的控制要求，使相应的输出接通或断开。预制的图形块(输入、输出、功能块、逻辑块)可被调用放置在屏幕上，通过按击鼠标连接上述图形块，即可形成完整的程序。功能块绘图方法是功能块方式应用之一。当功能块绘图(FBD)平面上的方块已被标示为输入或输出(可放置在平面的任何位置)，通过双击功能块和在选项设置中输人数据，即可定义定时值、开关图形、计数器、日期和时间值并将之运用于具体的程序中。程序的每——部分在屏幕中用内部连接线相连，从而使系统中的各个部分的关系十分明确，且编程和以后的故障查找都十分容易。由于功能块已经预先设置，任何人都能很快地认识到程序的哪一个部分在执行，也可以在V15软件中对功能块增加注释内容。当程序编制完成后，V15软件可在没有任何硬件的情况下以仿真模式运行程序。也就是说，在离线情况下完成编程后，在简单应用控制器的菜单中选取仿真模式，按击鼠标，使输入接通和关断．P1BD平面上的连接线将会闪烁，定时器的数值、输出的开关状态等将在屏幕上显示。超小型PC已广泛用于楼宇自动化、家居自动化、商业自动化、工控自动化、农业自动化等方面。