一、特别行政区政治体制的性质：所谓政治体制是指政权的组织形式和活动原则，特别行政区政权应该是以爱国者为主体的政权，是在统一的社会主义国家内的特殊的地方政权。它既不同于内地的人民民主专政政权，也不同于资本主义国家的资产阶级专政政权。我国特别行政区实行港人治港、澳人治澳，与此相应，港、澳特别行政区的政权组织形式应根据各自的实际情况，采取同以爱国者为主体的政权性质相适应的政治体制。

二、特别行政区显著特质是的行政长官制，在行政长官制的体制下，特别行政区行政、立法和司法三者的关系是：司法独立、行政主导；行政机关与立法机关相互制衡，又相互配合。（一）互相制衡体现在以下几个方面：1、行政长官决定是否签署法案。2、行政长官有权解散立法会，行政长官在其一任任期内只能解杉立法会一次。3、立法会可迫使行政长官辞职。行政长官有以下列情况之一者必须辞职：一是因两次拒绝签署立法会通过的法案而解散立法会，重选的立法会仍以全体议员三分之二多数通过所争议的原案，而行政长官仍拒绝签署；二是因立法会拒绝通过财政预算案或其他重要法案而解散立法会，重选的立法会继续拒绝通过所争议的原案。4、立法会有权弹劾行政长官。如立法会全体议员的四分之一（香港）、三分之一（澳门）联合动议，指控行政长官有严重违法或渎职行为而不辞职，立法会就有权通过动议，委托香港终审法院首席法官（澳门终审法院院长）负责组成独立的调查委员会进行调查。调查委员会如认为有足够证据构成上述指控，立法会以全体议员三分之二多数通过，可提出弹劾案，报请中央人民政府决定。5、行政机关对立法机关负责。港、澳特别行政区政府必须遵守法律，对特别行政区立法会负责：执行立法会通过并已生效的法律；定期向立法会作施政报告；答复立法会议员的质询。（二）行政与立法相互配合，主要体现在以下几个方面：1、在香港儿澳门特别行政区，分别蚢有协助行政长官决策的机构，即香港的行政会议和澳门的行政会。2、按照法律规定的程序，行政长官在解散立法会之前除了须征询行政会议（行政会）的意见外，还应先行协商，经与立法会协商仍不能取得一致意见，才可以行使解散权。3、在立法会举行会议的时候，政府应委派官员列席并代表政府在会议上发言，就有关问题作出说明，以便相互了解和沟通。4、在香港特别区，立法的部分议员由选举委员会选举产生。（三）行政主导，主要体现在：（1）行政长官地位显要；（2）在行政与立法的关系中，行政处于主动地位。（3）行政会议角色独特。行政会议的设立是体现行政主导的重要方面。由于它的惟一任务就是协助行政长官决策，向行政长官提供意见。（四）司法独立。